1989年5月，国务院批准在福州经济技术开发区内设立福州台商投资区（1.8平方公里）。福州台商投资区成立以来，依托国家级福州经济技术开发区、保税区、高科技园区的政策优势和近台的区域优势，吸引了众多的台商进区投资，至今在1.8平方公里的范围内已全部摆满项目，成为台商在中国大陆投资最集中的地区之一。1996年8月国家交通部决定将福州、厦门港区作为海峡两岸间船舶定点直航的试点口岸，为台商投资区的进一步发展注入新的生机。1997年1月，福建省人民政府决定将台商投资区向闽江入海口延伸扩大6平方公里，并上报国务院。扩大范围的新区面向二十一世纪，以闽台经济合作为重点，港（港口）区（投资区）合一，联动开发，使之成为海峡两岸率先局部“三通”的先行口岸和贸易航运中心。扩区后的福州台商投资区将加快承接台湾先进制造业、高新技术产业、现代农业和服务业转移，突出发展金属加工、装备机械制造、轻工食品加工、新材料、生产性服务业等产业。